Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl43Q99N89 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl43Q99N89 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl43Q99N89 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl43Q99N89 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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