Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrps18aQ99N85 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrps18aQ99N85 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms