Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdac9Q99N13 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms