Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tdrd1Q99MV1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms