Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms