Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprtQ99M80 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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