Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cstf3Q99LI7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cstf3Q99LI7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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