Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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