Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp16Q99LG0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms