Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1dQ99246 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms