Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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