Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clip1Q922J3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms