Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Med28Q920D3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms