Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Creb3l3Q91XE9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms