Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac11Q91WA3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms