Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp3Q91W36 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms