Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zkscan3Q91VW9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zkscan3Q91VW9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms