Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf130Q8VEM1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf130Q8VEM1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf130Q8VEM1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf130Q8VEM1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf130Q8VEM1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf130Q8VEM1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf130Q8VEM1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf130Q8VEM1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf130Q8VEM1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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