Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Slc6a20aQ8VDB9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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