Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sgip1Q8VD37 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms