Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc58Q8R3Q6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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