Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stn1Q8K2X3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms