Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brd3Q8K2F0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms