Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nek9Q8K1R7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nek9Q8K1R7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nek9Q8K1R7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nek9Q8K1R7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms