Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms