Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sphk1Q8CI15 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms