Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnka2ipQ8CH19 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms