Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr47Q8CGF6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms