Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SynpoQ8CC35 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SynpoQ8CC35 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms