Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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