Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8E0

Gm13199, Predicted gene 13199, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13199Q8C8E0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm13199Q8C8E0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms