Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933409G03RikQ8C5U0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933409G03RikQ8C5U0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms