Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8C5C9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms