Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FarsaQ8C0C7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FarsaQ8C0C7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FarsaQ8C0C7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FarsaQ8C0C7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FarsaQ8C0C7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FarsaQ8C0C7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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