Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms