Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ube3dQ8BX13 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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