Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4aQ8BU40 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4aQ8BU40 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp4aQ8BU40 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp4aQ8BU40 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4aQ8BU40 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms