Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV1

Tusc3, Tumor suppressor candidate 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc3Q8BTV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tusc3Q8BTV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tusc3Q8BTV1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms