Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Suds3Q8BR65 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms