Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik4Q8BMF5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms