Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Atg4bQ8BGE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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