Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Htatsf1Q8BGC0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htatsf1Q8BGC0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htatsf1Q8BGC0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htatsf1Q8BGC0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms