Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M10.4Q85ZW8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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