Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5bQ80Y84 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms