Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms