Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf139Q7TMV1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms