Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmed3Q78IS1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms