Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms