Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cxcl3Q6W5C0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms