Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms